直接觀看文章

我們的基因體時代 Our "Gene"ration

learning together with great scientist, coding and bioinformatics

  • About
  • 原則
  • 系列文章
    • 學習html5和css3:踏入瀏覽器外衣的世界(一)
    • 深入R語言Object-Oriented Programming(二)：開發ggplot2延伸套件所使用的ggproto系統(未完)
    • 理解Bioconductor系列（一）：Bioconductor中的Annotation資源
    • 理解Bioconductor系列（二）：AnnotationDbi，決定annotation database的基本結構
    • 使用purrr package學functional programming的觀念（五）：一行同時讀取多個檔案，彙整成單一個data.frame且新增欄位
    • 深入R語言（二）：如何選擇編寫程序的策略來符合不同的計算需求（small, medium, large）
    • 深入R語言Object-Oriented Programming(一)：S3, S4, R6, Reference Class
    • 使用purrr package學functional programming的觀念（四）：search
    • 結合GWAS和RNAseq來實現個人化醫療：WHOLE approach(一)
    • 使用purrr package學functional programming的觀念（三）：reduce
    • 使用purrr package學functional programming的觀念（ㄧ）：簡介
    • 使用purrr package學functional programming的觀念（二）：map family
    • 使用基因功能分類GO(Gene Ontology)分析(一)：簡介
    • 使用基因功能分類GO(Gene Ontology)分析(二)：GO term的結構
    • BioC2016: Where Software and Biology Connect 會議系列一
    • BioC2016: Where Software and Biology Connect 會議系列二
    • BioC2016: Where Software and Biology Connect 會議系列三
    • 使用R做Network Analysis系列一：5-number summary for a network
    • 文獻閱讀：RNAseq在臨床應用的可能和挑戰(上)
    • 文獻閱讀：RNAseq在臨床應用的可能和挑戰(中)
    • 文獻閱讀：RNAseq在臨床應用的可能和挑戰(下)
  • 視覺化設計
    • 深入染色體組型視覺化調研（一）（karyotype visualization/ideogram）
    • 使用D3.js做複雜資料視覺化（一）：簡介
    • 書籍閱讀：Visualization Analysis & Design
    • End-to-End 視覺化框架工具設計：vue2+koa2+d3.js（整理中）
    • 搭建多層式網絡視覺化(visualization of the multilayer network)模型: 使用three.js, d3.js , Lodash 和observable(ㄧ)
    • 使用D3.js做複雜資料視覺化（三）：理解transition的控制來設計動畫效果
    • 使用D3.js做複雜資料視覺化（二）：處理巢狀資料(nested data with nested selection)
    • Observable:互動式Ｄ3.js環境，讓你專注於資料視覺化，而不用費心於測試環境
    • 書籍閱讀：Envisioning Information
    • 閱讀Mike Bostock文章：What Makes Software Good?
    • 使用D3.js做複雜資料視覺化（一）：簡介
    • 書籍閱讀：The Visual Display of Quantitative Information
    • 百度開發的視覺化工具ECharts 3
    • 網絡視覺化分析工具Cytoscape簡介
    • 使用D3.js做複雜資料視覺化（二）：處理巢狀資料(nested data with nested selection)
    • 論文閱讀:多層網絡(multilayer networks)(一）
  • 探索資料庫
    • Ensembl API（一）：簡介
    • Ensembl API（二）：安裝 API
    • 探索資料庫應用（一）：美國NIH LINCS（Library of Integrated Network-based Cellular Signature）計劃
    • 探索資料庫應用（一）：美國NIH LINCS（Library of Integrated Network-based Cellular Signature）計劃
    • 探索資料庫應用（二）：Taiwan Biobank台灣生物資料庫計畫
    • 探索資料庫應用（三）：UALCAN快速查找TCGA基因表現和存活分析的資料庫
    • 探索資料庫應用（四）：PharmGKB：藥物基因體資料庫
    • 探索資料庫應用（五）Gene Transcription Regulation Database(GTRD):轉錄因子調控資料庫
    • 探索資料庫應用（六）MeSH (Medical Subject Headings):美國國家醫學圖書館架構的醫學詞彙索引
    • The Monarch Initiative：藉由跨物種的比較延伸人類表行(Phenotype)和基因型(Genotype)的資料
    • 2017 24th Nucleic Acids Research 資料庫特輯
    • 癌症研究資料的雲端服務NCI Genomic Data Commons
    • 做GSEA分析的重要基因組（gene set）參考資料庫： The Molecular Signatures Databases (MSigDB)
    • 藥物治療分類代碼系統ATC code

原則

實踐Principles: work and life這本書裡頭的概念，讓自己的決定能根據幾個原則，持續地修繕和調整。以下是我的原則：

  1. 維持健康
  2. 維持與家人的相處時間
  3. 徹底透明和開放想法
  4. 保持紀律
  5. 用方法學習

分享此文：

  • Twitter
  • Facebook
  • Google

請按讚：

讚 載入中...

我們的基因體時代 Our "Gene"ration

learning together with great scientist, coding and bioinformatics

近期文章

  • 書籍閱讀：Bad Blood: Secrets Lies in a Silicon Valley Startup
  • 2018 Rocky Bioinformatic Conference 行腳
  • 論文閱讀：Next-Generation Sequencing to Diagnose Suspected Genetic Disorders
  • 論文閱讀：Genome sequencing in the clinic: the past, present, and future of genomic medicine
  • 國際視覺化會議 2018 IEEE VIS 德國柏林

近期迴響

搭建多層式網絡視覺化(visualiza… 在 論文閱讀:多層網絡(multilayer networks)…
搭建多層式網絡視覺化(visualiza… 在 書籍閱讀：The Visual Display of Qua…
書籍閱讀：Being Online在線-… 在 書籍閱讀：The Nature of Technology:…
kaiwu 在 簡介 快速健康照護互通資源 (FHIR)及相關學習資源
簡介 快速健康照護互通資源 (FHIR)… 在 健康資訊交換第七層協定(Health Level Seven…

文章存檔

  • 2019 年 一月
  • 2018 年 十二月
  • 2018 年 十一月
  • 2018 年 十月
  • 2018 年 九月
  • 2018 年 八月
  • 2018 年 七月
  • 2018 年 六月
  • 2018 年 五月
  • 2018 年 四月
  • 2018 年 三月
  • 2018 年 二月
  • 2018 年 一月
  • 2017 年 十二月
  • 2017 年 十一月
  • 2017 年 十月
  • 2017 年 九月
  • 2017 年 八月
  • 2017 年 七月
  • 2017 年 六月
  • 2017 年 五月
  • 2017 年 四月
  • 2017 年 三月
  • 2017 年 二月
  • 2017 年 一月
  • 2016 年 十二月
  • 2016 年 十一月
  • 2016 年 十月
  • 2016 年 八月
  • 2016 年 六月
  • 2016 年 五月
  • 2016 年 四月
  • 2016 年 三月
  • 2016 年 二月
  • 2016 年 一月
  • 2015 年 十二月
  • 2015 年 十一月
  • 2015 年 十月

分類

  • bioinformatics
  • Biostatistics
  • book
  • cancer
  • Code
  • docker
  • Ensembl API
  • Gene Ontology
  • genedock實習準備
  • ggplot2
  • LDT
  • Medical Information
  • python
  • R
  • reddit
  • RNAseq
  • samtools
  • Softward
  • 未分類

其它

  • 註冊
  • 登入
  • 文章 RSS 訂閱
  • 迴響 RSS 訂閱
  • WordPress.com

分類

  • bioinformatics
  • Biostatistics
  • book
  • cancer
  • Code
  • docker
  • Ensembl API
  • Gene Ontology
  • genedock實習準備
  • ggplot2
  • LDT
  • Medical Information
  • python
  • R
  • reddit
  • RNAseq
  • samtools
  • Softward
  • 未分類
在WordPress.com寫網誌.
%d 位部落客按了讚：