系列文章

彙整一下血淚，以便不時回顧和改寫！

醫學

• 結合GWAS和RNAseq來實現個人化醫療:WHOLE approach （一）

生物資訊

• 生物資訊入門書推薦：The Biostar Handbook
• 次世代定序資料分析學習資源(NGS analysis learning material)
• RNAseq基因表現亮常用指標：RPKM, FPKM, TPM
• 在進行變異確認(Variant Calling)前的序列品質校正（Base Quality Recalibration）流程
• Bioconductor:基因體學研究的好幫手
• 理解Bioconductor系列 (一）：Bioconductor中的Annotation資源理
• Bioconductor系列(二）：AnnotationDbi 決定annotation database的基本結構
• 使用基因功能分類GO(Gene Ontology)分析(一）：簡介
• 使用基因功能分類GO(Gene Ontology)分析（二）：GO term的結構
• Gene Ontology term分析的二三事：常用、誤用、濫用的例子
• 將有興趣的基因列表使用org.Hs.eg.db查找最新的對應GO terms，再使用topGO做GO analysis
• 使用AmiGo和QuickGO來獲取Gene Ontology資料

會議

• 文獻閱讀：RNAseq在臨床應用的可能和挑戰（上）
• 文獻閱讀：RNAseq在臨床應用的可能和挑戰（中）
• 文獻閱讀：RNAseq在臨床應用的可能和挑戰（下）
• 文獻閱讀：Interpretation of biological experiments changes with evolution of the Gene Ontology and its annotation

軟體

• 學習html5和css3:踏入瀏覽器外衣的世界(ㄧ）
• 深入R語言Object-Oriented Programming(二）：開發ggplot2延升套件所使用的ggproto系統(未完）
• 使用Purr packge學functional programming的觀念（五）：一行同時讀取多個檔案，彙整成單一個data.frame且新增欄位
• 深入R語言（二）：如何選擇程序的策略來符合不同的計算需求 (small, medium, large)
• 深入R語言Object-Oriented Programming(ㄧ）：S3, S4, R6, Reference Class
• 使用Purrr package 學習functional programming的觀念（四）：Search
• 使用Purrr package學習functional programming的觀念（三）：reduce
• 使用Purrr package學習functional programming的觀念（二）：map family
• ＢioC2016:Where Software and Biology Connect 會議系列一
• ＢioC2016:Where Software and Biology Connect 會議系列二
• ＢioC2016:Where Software and Biology Connect 會議系列三
• 使用R做Network Analysis系列一：5-number summary for a network