XML（extensible markup language）全名可擴展標記語言，是一種在文本文件中組織數據的語言，使用簡單的樹狀結構定義資料，在過去十年中，XML數據格式已經成為大型機構常用的數據傳輸格式，如政府網站、NCBI的Pubmed,  Mesh數據庫等。

XML文檔結構會根據一份文件類型定義（Document Type Definition, DTD）組織其內節點而成，而DTD則可以自行定義，如NCBI裡XML文件的DTD文件，裡頭就會詳述基本的文件結構，所有xml節點則會以其定義的DTD來儲存資料。所以當取得一份xml文件時，可以順便了解其DTD文檔，加速處理資料的速度。

XML的結構簡單，一個XML文件代表一個結構化的訊息樹，如下圖示，為從NCBI取得的xml格式資料：

一份DTD文件，其從上而下定義其文件的包含節點，但以扁平方式來表達文件結構，從下面由US National Library of Medicine取得關於MEDLINE^®/PubMed^® DTD