在爬梳藥物基因體相關資料時，很重要的便是去理解藥品的編碼系統，因為同一類藥品通常名字有很多種，不同國家的藥物編碼也不同，常混者商品名等等，使用編碼系統可以免去名稱混亂所造成的問題，且要是有一套國際使用的編碼系統變可以使得國間的資訊可以共通。目前世界常用的藥物分類編碼系統有兩種，一種是AHFS(American Hospital Formulary Service)/DI(Drug Information)和WHO(World Health Organization)/ATC(Anatomical Therapeutic Chemical Classification)。傳統上使用這套系統便能做很好的藥品項目管理、評估用藥品質、效益分析等等（因為有統一的代碼，所以各國資料可以彙整在一起，所以當要把基因資訊跟藥物彙整，當然會需要使用到藥物編碼系統）。

這邊來記錄一下ATC code的系統：

一個藥物的完整ATG code總共有七位由英文和數字組成，由左到右，不同位置代表的東西不同，共分成五組，分別代表一個藥物所主要作用的器官系統、治療哪類人體功能問題、藥物化學組成的成分、藥物動力學上的組別來表示：

第一層：第一位，為一個大寫字母，總共有14個字母，代表藥物主要作用的目標人體器官系統

A: Alimentary tract and metabolism
B: Blood and blood forming organs
C: Cardiovascular system
D: Dermatologicals
G: Genito-urinary system and sex hormone
H: System hormonal preparations, excluding sex hormones and insulins
J: Anti-infectives for systemic use
L: ANtineoplastic and immumodulating agents
M: Musculo-skeletal system
N: Nervous system
P: Antiparasitic products, insecticides and repellents
R: Respiratory system
S: Sensory organs
V: Various

第二層：第二三位，由兩個數字組成，代表藥物所屬於的治療功能類別

ex: C03 Diuretics

第三層：第四位，為一個大寫字母，代表藥物在藥物動力上的組別

ex: C03C High-ceiling diuretics

第四層：第五位，為一個大寫字母，藥物在化學特性上的組別

ex: C03CA Sulfonamides

第五層：第六七位，為兩個數字組成，藥物實際所屬於的分子特性組別

ex: C03CA01 Furosemide