在複雜的RNAseq甚至最近的single cell sequencing,在fastq上所顯示的資訊越來越複雜,且很多統計上的方法其實也會使用到這些資訊,所以多少要理解一下。而要理解這些資訊就需要知道測序晶片上面的一些命名,雖然不同型號的有所差異,但概念差不多,可以由下圖體會一下感覺
下面則可以看相關fastq上面每個reads上都會有的編碼,和相關意思的對照
Illumina sequence identifiers
閱讀參考:
Question: illumina instrument type from fastq?
https://www.biostars.org/p/198143/
FASTQ format
https://en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_format