獲取由Gene Ontology Consortium提供的Gene ontology資料有很多種方式，主要可以分為：
1. 網頁介面
2. 直接下載
3. 使用API

這邊分享兩個主要的網頁介面可以用來獲取Gene Ontology的資料：AmiGO、QuickGO

AmiGO
為Gene Ontology Consortium官方支持的網頁工具，由NHGRI-NIH所贊助，所以會根據NHGRI-NIH所補助的方向來發展，在網頁裡可以直接query, browse, visualizing GO的資料和從MOD, UniProtKB及其他地方搜集而來的annotation，詳細的來源可以參考，具有wizard interface，最近已大幅度提升運行速度，增加許多其他的資料型態可供使用如display of annotation extensions, protein form(splice variants and proteins with post translational modification)。

QuickGO
由EMBL-EBI資助，為The Gene Ontology Annotation Project中的一部份項目在，他比較獨特的是提供filter capabilities for GO annotation, powerful integrated subset/slim interface, 和historical view of the term.